目前已发现四种圆环病毒科圆环病毒属的猪圆环病毒,即PCV1~PCV4,其中给世界养猪业带来巨大经济损失的是由PCV2感染造成的,其也成为猪病研究中的热点和难点。有关圆环病毒的起源,最早有报道其是由植物病毒感染脊椎动物后与感染脊椎动物的动物病毒重组而来;后续也有研究认为其来自蝙蝠、鱼类等动物。
近日,兽医所动物腹泻病防控团队在《Frontiers in Veterinary Science》期刊发表题为“Phylogenetic analysis of porcine circovirus 2 and its related viruses”的研究成果。团队在前期发现的类猪圆环病毒和类猪圆环病毒微小因子的基础上,利用生物信息学分析,揭示猪圆环病毒可能起源于长度不足200的不具编码蛋白能力的核苷酸片段,其二级结构类似于感染植物的类病毒的棒状结构;然后按照类猪圆环病毒微小因子——类猪圆环病毒——PCV2依次演化。演化中圆环病毒的蛋白结构由于衣壳蛋白特定氨基酸的变化也发生了变化。此结果不仅纠正了先前认为类猪圆环病毒是由PCV2重组形成的观点,也为“先有核酸还是先有蛋白质”的研究提供了新视野。审稿人感谢团队所付出的努力,评价该研究对全球养猪业具有重要的贡献和实际意义。

江苏省农业科学院兽医所为论文第一完成单位,温立斌研究员为第一作者,与何孔旺研究员为共同通讯作者。
论文链接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fvets.2025.1711361
PCV2目前有九个基因型,PCV2a~PCV2i,优势基因型已经历了PCV2a到 PCV2b及PCV2b到 PCV2d的两次过渡。团队对来自2014~2021年江苏省13个地市的2675份样品进行了检测,结果表明41.42%的样品为PCV2阳性,由PCV2a、PCV2b、PCV2d和PCV2i组成,其中接近50%的基因型为PCV2d。该成果不仅证实了PCV2i的存在,也首次解析了该基因型基因组的核苷酸特征。相关论文“Frequency and genetic analysis of porcine circovirus type 2, which circulated between 2014 and 2021 in Jiangsu, China”发表在《Animals》期刊。

江苏省农业科学院兽医所为论文第一完成单位,肖琦副研究员为第一作者,温立斌研究员与何孔旺研究员为共同通讯作者。
论文链接:doi: 10.3390/ani14192882
团队先后发现并报道了四种类猪圆环病毒,P1~P4,其中类猪圆环病毒P1是目前所知基因组最小的动物病毒,仅包含648或649个核苷酸。团队的研究表明,P1 病毒经过近二十年的演化已出现 A、B 两个分支。A分支的P1病毒占绝对优势,该分支的病毒基因组由648个核苷酸组成,其衣壳蛋白由114或122个氨基酸组成;B分支的P1病毒基因组由649个核苷酸组成,其衣壳蛋白由163个氨基酸组成。P1病毒基因组富含 AT 核苷酸,密码子使用模式受二核苷酸组成的影响,其中UU/CC 呈现过表达特征,而 CG 则为低表达。P1 病毒的平均进化速率为 3.64×10-4 个核苷酸替换/位点/年,介于PCV2和PCV3之间。中性检验结果呈负值。相关成果“Nearly 20 years of genetic diversity and evolution of porcine circovirus-like virus P1 from China” 发表在《Viruses》期刊。随后被《Prime Archives in Virology》图书收录。

江苏省农业科学院兽医所为论文第一完成单位,温立斌研究员为第一作者,与何孔旺研究员为共同通讯作者。
论文链接:doi: 10.3390/v14040696
上述研究得到了国家自然科学基金的资助。